Widok zawartości stron
Nawigacja okruszkowa
Widok zawartości stron
Widok zawartości stron
Widok zawartości stron
Widok zawartości stron
Rozbudowa systemu obliczeniowego na Wydziale Farmaceutycznym
W ramach środków finansowych POB qLife sfinansowana została rozbudowa sprzętu komputerowego Wydziału Farmaceutycznego UJCM.
Zakupiono macierz dyskową firmy QNAP wyposażoną w 8 dysków talerzowych o nominalnej pojemności 80 TB. Sprzęt został skonfigurowany w systemie RAID 6 – najnowocześniejszym systemie macierzy dyskowych zapewniającym realną przestrzeń dyskową na poziomie 60 TB. Gwarantowane jest pełne zabezpieczenie danych nawet w razie jednoczesnej awarii dwóch z 8 dysków macierzy. Macierz dyskowa podłączona jest łączem 1Gbit/s ze światem zewnętrznym co zapewnia możliwość efektywnego transferu dużych ilości danych i pozwala na w pełni zdalną pracę. Sprzęt posiada również możliwość rozbudowy o dalsze 80 TB nominalnej powierzchni dyskowej.
Jest wykorzystywany do magazynowania danych wejściowych oraz wyników obliczeń i symulacji komputerowych prowadzonych w ramach prac naukowych na Wydziale Farmaceutycznym UJCM oraz w ramach prac Laboratorium Bioinformatyki i Analiz in silico (LBA) powołanego w ramach projektu CDT-CARD:
- przetwarzanie obrazów i obliczenia za pomocą systemów uczenia głębokiego (Deep Learning)
- modelowanie QSAR dla substancji o aktywności na układ serotoninergiczny
- optymalizacja składu i identyfikacja mechanizmów procesów uwalniania substancji leczniczych ze stałych postaci leku
- korelacja (IVIVC/IVIVR) i ekstrapolacja in vitro in vivo (IVIVE)
- ocena in silico potencjalnej kardiotoksyczności substancji chemicznych
Ww. prace obliczeniowe zwłaszcza w dziedzinie analizy obrazu wymagają bardzo dużych przestrzeni dyskowych zwłaszcza podczas porównywania uzyskanych wyników między sobą. Zarówno przestrzeń magazynowa dysków twardych jak i szybkość łącza pozwalają na dynamiczne podłączanie zasobów do komputerów klienckich i zdalną obróbkę tak wymagających danych. Dodatkowo wydzielona przestrzeń dyskowa stanowi magazyn prototypów oraz działających maszyn wirtualnych w oparciu o oprogramowanie VMWare pracujące na serwerach laboratorium LBA. Dzięki temu możliwe jest uruchamianie specjalnie skonfigurowanych do wyznaczonych zadań maszyn wirtualnych, ich klonowanie i włączanie w razie potrzeby na innej stacji roboczej w celu zapewnienia optymalnej mocy obliczeniowej dla wyznaczonych zadań.
Zakup dokonany ze środków finansowych Priorytetowego Obszaru Badawczego qLIFE w ramach programu strategicznego Inicjatywa Doskonałości w Uniwersytecie Jagiellońskim.
Polecamy również
